Le genre Apis mellifera comporte vingt-huit sous-espèces (toutes fécondables entre elles) réparties en cinq groupes majeurs (selon leurs évolutions et leurs répartitions géographiques) basés sur le travail de Friedrich Ruttner et confirmés par l’analyse de l’ADN mitochondrial :

 Lignée ou type A (groupe Africain)
        – Apis mellifera adansonii (Latreille)
        – Apis mellifera capensis (Eschscholtz)
        – Apis mellifera intermissa (Maa)
        – Apis mellifera litorea (Smith)
        – Apis mellifera monticola (Smith)
        – Apis mellifera sahariensis (Baldensperger)
        – Apis mellifera scutellata (Lepeletier)
        – Apis mellifera sicula (Montagano)
        – Apis mellifera unicolor (Latreille)
Lignée ou type C (groupe Carniole, de l’Europe de l’Est et du sud des Alpes)
        – Apis mellifera carnica (Pollman)
        – Apis mellifera cecropia (Kiesenwetter)
        – Apis mellifera ligustica (Spinola)
        – Apis mellifera macedonica (Ruttner)
Lignée ou type M (groupe Méditerranéen, de l’Ouest et du Nord)
        – Apis mellifera iberica (Engel)
        – Apis mellifera mellifera (Linnaeus)
        – Apis mellifera siciliana (Grassi)
 Lignée ou type O (groupe du Moyen-Orient et de l’Asie centrale)
        – Apis mellifera adami (Ruttner)
        – Apis mellifera anatoliaca (Maa)
        – Apis mellifera armeniaca  (es)
        – Apis mellifera caucasia (Pollmann)
        – Apis mellifera cypria (Pollman)
        – Apis mellifera lamarckii (Cockerell)
        – Apis mellifera meda (Skorikov)
        – Apis mellifera syriaca (Skorikov)
        – Apis mellifera taurica (Alpatov)
Lignée ou type Y (groupe Nord-Est, de l’Éthiopie et du Yemen )
        – Apis mellifera jemenitica (Ruttner)